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死亡微生物的粘附性:土壤中微生物殘?bào)w快速的非生物固定機(jī)制

日期: 2022-08-17
標(biāo)簽:




文獻(xiàn)解讀

BAIHUI

原名:Sticky dead microbes: Rapid abiotic retention of microbial necromass in soil


譯名:死亡微生物的粘附性:土壤中微生物殘?bào)w快速的非生物固定機(jī)制

期刊:Soil Biology and Biochemistry


IF:8.5(2021


發(fā)表時(shí)間:2020年8月14日


第一作者:???Kate M.Buckeridge


通訊作者:Kate M.Buckeridge


主要單位:

Lancaster Environment Centre, University of Lancaster, Lancaster, UK

UK Centre for Ecology & Hydrology, Lancaster, UK


死亡微生物的粘附性:土壤中微生物殘?bào)w快速的非生物固定機(jī)制


01
摘要

微生物殘?bào)w主導(dǎo)土壤有機(jī)質(zhì)。最近關(guān)于殘?bào)w和土壤碳儲(chǔ)存的研究主要集中在殘?bào)w的產(chǎn)生和穩(wěn)定機(jī)制,而不是殘?bào)w的固定機(jī)制。我們使用穩(wěn)定同位素標(biāo)記微生物殘?bào)w進(jìn)行土壤培養(yǎng)試驗(yàn)。結(jié)果表明,對(duì)于短期的殘?bào)w固定,非生物吸附固定可能比生物固定更重要。我們證明了殘?bào)w吸附固定不僅發(fā)生在礦物表面,還可能與其他殘?bào)w相互作用。此外,殘?bào)w化學(xué)性質(zhì)能改變殘?bào)w之間的相互作用,當(dāng)存在酵母殘?bào)w時(shí),細(xì)菌示蹤殘?bào)w會(huì)保留更多。這些發(fā)現(xiàn)表明,除了化學(xué)穩(wěn)定性之外,微生物殘?bào)w的吸附和非生物相互作用及其功能特性需要在土壤固碳的背景下進(jìn)一步研究。

關(guān)鍵詞:

土壤有機(jī)質(zhì),功能特性,穩(wěn)定同位素,草地牧場(chǎng),碳固持,氮

02
背景

土壤有機(jī)質(zhì)(SOM)是土壤健康和可持續(xù)農(nóng)業(yè)的關(guān)鍵指標(biāo)。對(duì)SOM穩(wěn)定性的研究傳統(tǒng)上側(cè)重于植物對(duì)土壤輸入的質(zhì)量和數(shù)量,然而,最近的研究表明,SOM主要由死亡的微生物產(chǎn)物和殘?bào)w主導(dǎo)。殘?bào)w在土壤中的持留時(shí)間可能受到殘?bào)w吸收固定到微生物生物量影響,但殘?bào)w固定最終依賴于其吸附到土壤礦物表面形成的微團(tuán)聚體。實(shí)際上,生物固定作用(微生物固定化)和非生物固定(吸附和分子相互作用)可能同時(shí)發(fā)生,但尚未有研究評(píng)估這些短期過(guò)程的相對(duì)重要性(圖1)。

礦物表面可觀察到微生物殘?bào)w,這支持以下觀點(diǎn):穩(wěn)定SOM的積累主要由有機(jī)-礦物吸附控制,并受礦物表面積限制。然而,實(shí)驗(yàn)檢測(cè)到的殘?bào)w并不是均勻的覆蓋在礦物表面,而是以塊狀形態(tài)存在,這表明SOM的穩(wěn)定性也可能包含有機(jī)物間的相互作用,或殘?bào)w通過(guò)離子相互作用、氫鍵、范德華力、(部分)包埋作用和其他殘?bào)w及有機(jī)質(zhì)粘連(圖1)。了解這兩個(gè)非生物吸附過(guò)程的相對(duì)重要性對(duì)于預(yù)測(cè)SOM持留時(shí)間的上限至關(guān)重要。

微生物殘?bào)w的化學(xué)性質(zhì)被認(rèn)為是SOM儲(chǔ)存的不重要調(diào)節(jié)因素,因?yàn)橄啾炔煌闹参镙斎?,其化學(xué)成分更為相似。以往關(guān)于殘?bào)w化學(xué)性質(zhì)和持久性的研究集中于其穩(wěn)定性,并強(qiáng)調(diào)幾丁質(zhì)的固定。然而,細(xì)胞化學(xué)性質(zhì)可以改變細(xì)胞間粘附率和有機(jī)-礦物吸附率,尤其是對(duì)于富含N的殘?bào)w。革蘭氏陽(yáng)性細(xì)菌包膜在脂膜外有一層厚的交聯(lián)肽聚糖層,而革蘭氏陰性細(xì)胞包膜在內(nèi)外脂膜間包含有一層較薄的肽聚糖層。真菌細(xì)胞壁成分高度復(fù)雜;例如,酵母細(xì)胞壁脂膜外由多層甘露聚糖、β-葡聚糖和幾丁質(zhì)組成。因此,相對(duì)于革蘭氏陰性細(xì)菌或真菌,富含肽聚糖的革蘭氏陽(yáng)性細(xì)菌等具有高N含量的細(xì)胞膜官能團(tuán)可能有利于有機(jī)-有機(jī)相互作用。鑒于全球變化、土地利用變化甚至季節(jié)性可能導(dǎo)致的微生物群落組成潛在的廣泛變化,殘?bào)w化學(xué)性質(zhì)可能會(huì)影響生態(tài)系統(tǒng)規(guī)模上的SOM穩(wěn)定性。

我們研究了草地土壤中生物和非生物殘?bào)w固定的重要性,以及在短期實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)中殘?bào)w化學(xué)性質(zhì)對(duì)這種固定的影響。我們提出如下假設(shè):H1、生物和非生物殘?bào)w固定均可發(fā)生,但生物固定更為重要;H2、殘?bào)w的背景濃度越高;土壤中固定的殘?bào)w越多(表明產(chǎn)生有機(jī)-有機(jī)粘附);和H3、革蘭氏陽(yáng)性細(xì)菌膜的非生物固定更高(這意味著細(xì)胞化學(xué)性質(zhì)很重要)。

03
結(jié)果

活性土壤中示蹤殘?bào)w的C固定率比滅菌土低(P=0.006),因此拒絕假設(shè)H1,表明殘?bào)wC的短期固定主要由非生物過(guò)程控制(>70%)(圖2a)。然而,我們的結(jié)果不能證實(shí)生物過(guò)程對(duì)持續(xù)的SOM-C累積不重要。我們控制的環(huán)境培養(yǎng)條件可能高估了非生物過(guò)程的重要性:在一個(gè)具有活躍的植物-微生物相互作用的動(dòng)態(tài)自然系統(tǒng)中,活微生物固定殘?bào)wC,植物和微生物吸收/固定殘?bào)wN可能對(duì)殘?bào)w固定至關(guān)重要。此外,我們實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)的單一培養(yǎng)物僅能接近化學(xué)和分類學(xué)上復(fù)雜的天然殘?bào)w。盡管如此,我們的結(jié)果說(shuō)明了土壤中非生物碳固定的重要短期效應(yīng)。

活性土壤中的13C固定率比滅菌土壤中的固定率更低,我們認(rèn)為這可能是滅菌處理的副作用,或者是微生物活動(dòng)造成的CO2損失。但我們認(rèn)為滅菌處理影響很小,因?yàn)槲覀儧]有發(fā)現(xiàn)活性土中殘?bào)w15N的固定率與滅菌土相比也降低(圖2b)。滅菌土壤中示蹤殘?bào)w的C:N比沒有變化以及活性土壤中示蹤殘?bào)wC:N的下降(P<0.001,數(shù)據(jù)未展示)的結(jié)果等同于活性微生物C周轉(zhuǎn)過(guò)程:添加總C的4–10%的固定/損失(可提取的生物量或CO2損失)(圖3a和b)。標(biāo)記殘?bào)wN2O的損失與CO2相當(dāng)(<2%,圖3c),但我們推測(cè)微生物生物量的氮吸收(未測(cè)量)比C吸收更低,反映出在這些富氮農(nóng)牧土壤中,生長(zhǎng)對(duì)氮的需求較低。培養(yǎng)期間的C-饑餓作用可能導(dǎo)致微生物利用殘?bào)wC維持生命活動(dòng),這反映了底物利用效率(CUE)較低(圖3d)。

與對(duì)照組相比,有更高殘?bào)w濃度背景的滅菌和活性土壤中固定了更高的C和N(約高出10–40%,圖2a和b),這支持假設(shè)H2:殘?bào)w之間可能相互粘連。此前,基于實(shí)驗(yàn)室和長(zhǎng)期野外研究中的同位素和觀測(cè)證據(jù),已有研究提出有機(jī)-有機(jī)粘附機(jī)制。在具有更高肽聚糖(M. luteus)殘?bào)w的土壤中,我們沒有觀察到C和N的固定率更高,因此拒絕假設(shè)H3(即革蘭氏陽(yáng)性細(xì)菌膜的非生物固定率更高)。然而,我們提供了新的證據(jù)表明,在滅菌和活性土壤中,增加酵母殘?bào)w時(shí),標(biāo)記殘?bào)w中C和N的固定率更高(C, P<0.001;N, P=0.03)。在添加酵母殘?bào)w的土壤中,這種較高的微生物C和N的固定似乎不是通過(guò)生物固定過(guò)程,因?yàn)榛钚酝寥乐惺聚櫄報(bào)w的CUE在不同殘?bào)w類型之間沒有差異(圖3d)(盡管所有添加殘?bào)w的處理都低于無(wú)添加的對(duì)照,這可能是比對(duì)照更高底物濃度的響應(yīng))。相反,存在釀酒酵母殘?bào)w的情況下,示蹤殘?bào)w固定率的增加可能表明革蘭氏陰性細(xì)胞外膜和復(fù)雜酵母細(xì)胞壁形態(tài)之間更快或更強(qiáng)的相互作用,例如和在活的微生物群落中發(fā)生的相互作用一樣。我們需要進(jìn)一步開展化合物特異性研究,以期了解其他一般真菌殘?bào)w或特異的細(xì)菌細(xì)胞膜和真菌細(xì)胞壁化合物是否具備酵母殘?bào)w的特性。本文結(jié)果表明,細(xì)胞化學(xué)性質(zhì)有助于粘附機(jī)制,促進(jìn)土壤中殘?bào)w穩(wěn)定性。

死亡微生物的粘附性:土壤中微生物殘?bào)w快速的非生物固定機(jī)制

圖1. 礦質(zhì)土壤中微生物殘?bào)w形成及固定示意圖。圖中,殘?bào)w作為微生物的底物,類似于植物輸入(凋落物或分泌物)。微生物可以獲得與礦物結(jié)合或不結(jié)合的殘?bào)w。固定作用包括微生物將殘?bào)w再循環(huán)為新的生物量,最終形成殘?bào)w,并可能以CO2的形式產(chǎn)生一些損失。穩(wěn)定作用被認(rèn)為是通過(guò)吸附到礦物表面(“有機(jī)-礦物”)來(lái)實(shí)現(xiàn),尤其是在粘粉粒表面上。在本研究中,我們假設(shè)該過(guò)程不局限于發(fā)生在礦物表面(“有機(jī)-礦物”),也發(fā)生在殘?bào)w間的相互作用(“有機(jī)-有機(jī)”)上。這些過(guò)程促進(jìn)殘?bào)w固定,并且該“有機(jī)-有機(jī)”結(jié)合過(guò)程可能受到殘?bào)w化學(xué)性質(zhì)的影響。

死亡微生物的粘附性:土壤中微生物殘?bào)w快速的非生物固定機(jī)制

圖2.?具有不同背景殘?bào)w的活性和滅菌土壤中殘?bào)w碳氮的固定(13C15N-E.coli)。在活性土壤(微生物固定和吸附)和無(wú)菌土壤(僅吸附)中培養(yǎng)3天后,以(a)碳或(b)氮形式固定的13C15N殘?bào)w。為期3天的培養(yǎng)結(jié)束后,分析水提取后殘留土壤中標(biāo)記殘?bào)w剩余量的百分?jǐn)?shù)作為殘?bào)w固定率。

死亡微生物的粘附性:土壤中微生物殘?bào)w快速的非生物固定機(jī)制

圖3.?具有不同背景殘?bào)w的活性土壤中殘?bào)w示蹤劑(13C15N-E.coli)的氣體損失、生物固定和碳利用效率。在3天培養(yǎng)后,(a)標(biāo)記殘?bào)w礦化的CO2,(b)標(biāo)記殘?bào)w再利用產(chǎn)生的微生物量C,(c)標(biāo)記殘?bào)w礦化的N2O,(d)碳利用效率。

04
結(jié)論

我們的結(jié)論是,非生物過(guò)程對(duì)于土壤中殘?bào)wC和N的短期固定非常重要,需要在研究SOM穩(wěn)定性的研究中給予更大的重視。我們的結(jié)果表明,有機(jī)-有機(jī)相互作用促進(jìn)了碳和氮的固定,并提供了新的證據(jù),證明這種機(jī)制受細(xì)胞化學(xué)性質(zhì)調(diào)節(jié)。如果這種短期非生物固定發(fā)生在原位土壤并持續(xù)存在,那么微生物群落結(jié)構(gòu)以及真菌與細(xì)菌的比例可能會(huì)通過(guò)群落細(xì)胞化學(xué)性質(zhì)的變化影響碳和氮的穩(wěn)定性。在田間添加來(lái)自不同分類群、不同土壤的同位素標(biāo)記殘?bào)w,將有助于研究這些機(jī)制的長(zhǎng)期重要性。這些發(fā)現(xiàn)表明,微生物殘?bào)w的非生物吸附和殘?bào)w間相互作用及其化學(xué)穩(wěn)定性以外的功能特性(即細(xì)胞分子的特性、聚集和形態(tài))值得進(jìn)一步在土壤固碳背景下展開研究。


原文鏈接:?https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0038071720302261

DOIhttps://doi.org/10.1016/j.soilbio.2020.107929




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