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原名:Nematode biomass changes along an elevational gradient are trophic group dependent but independent of body size譯名:線蟲生物量沿海拔梯度的變化依賴于營養(yǎng)類群,而與體型無關期刊:Global Change BiologyIF: 11.6發(fā)表時間:2023.5第一作者:Guixin Li摘要背景:在地上,大型和高營養(yǎng)級生物對環(huán)境變化的反應往往比小型和低營養(yǎng)級的生物更強烈。然而,這種營養(yǎng)級或體型大小依賴的敏感性是否也適用于最豐富的動物,即微小的土壤線蟲,在很大程度上仍是未知的。方法:本實驗通過對青藏高原不同海拔樣帶的草原進行了采樣,并采用群落加權平均(CWM)方法,檢驗了氣候和土壤特性的差異在群落、營養(yǎng)群和分類群平均生物量水平對線蟲CWM生物量的影響。結果:研究表明,氣候和土壤特性,特別是土壤水分相關特性,對線蟲平均加權生物量有積極影響,而海拔對線蟲平均加權生物量沒有總體影響。高營養(yǎng)級的雜食和捕食性線蟲對氣候和土壤特征,尤其是溫度、土壤pH值和土壤含水量的響應強于低營養(yǎng)級的食細性和食真菌性線蟲。然而,這些差異可能不是由線蟲大小驅動的,因為氣候、土壤特性和營養(yǎng)群平均生物量之間沒有顯著相互作用。結論:這些結果表明,與低營養(yǎng)級線蟲相比,高營養(yǎng)級線蟲具有更強的但與大小無關的營養(yǎng)敏...
發(fā)布時間: 2023 - 07 - 05
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作者:
發(fā)布時間: 2021 - 08 - 20
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原名:Absorptive and transport roots differ in terms of their impacts on rhizosphere soil carbon storage and stability in alpine forests譯名:高寒森林吸收根和運輸根差異化調控根際土壤碳儲量和穩(wěn)定性期刊:Soil Biology and BiochemistryIF: 7.609發(fā)表時間:2021.08.10第一作者:汪其同通訊作者:尹華軍主要單位:中國科學院成都生物研究所摘要:根據(jù)木本植物細根形態(tài)、生理和功能特征的內(nèi)在差異,可將其分為吸收根和運輸根兩個功能模塊。不同功能模塊的根系對土壤生物地球化學過程的潛在生態(tài)效應已被廣泛認識。然而,由這兩個根系功能模塊驅動的根際土壤碳儲量的大小以及碳穩(wěn)定機制尚不清楚。在本研究中,我們量化了云杉人工林礦質層(0-15cm)吸收根和運輸根根際土壤有機碳含量和組分,進一步通過數(shù)值模型估算了兩個根系功能模塊不同根際范圍土壤C儲量。同時,通過分析根際土壤有機碳化學特征和金屬-有機復合體特征,區(qū)分兩個根系功能模塊對根際土壤有機碳穩(wěn)定性的差異化影響。結果表明,吸收根根際土壤有機碳含量比運輸根根際高15.7%,這主要是由于吸收根根際土壤有機碳的穩(wěn)定性(化學抗性和金屬-有機鍵)更強。數(shù)值模型分析表明,吸收根根際有機碳庫(0.27 ~ 2.7 kg C/m2)是運輸根根際(0.18 ~ 1.36 kg C/m2)的2倍。在根際1 mm范圍,吸收根根際土壤有機碳儲量對根際土壤有機碳總儲量的貢獻(63.5%)遠高于運輸根根際(36.5%)。上述結果表明,吸收根在高寒針葉林根際土壤碳中發(fā)揮主導作用。本研究強調基于功能的細根分類與根際土壤碳儲量結合運用于陸地表面土壤碳循環(huán)模型中具有重要意義,可為準確預測高寒針葉林生態(tài)系統(tǒng)土壤碳動態(tài)提供科學依據(jù)。研究背景:土壤有機碳(SOC)的形成、穩(wěn)定和周轉等動態(tài)變化過程已經(jīng)成為當前生態(tài)學和土壤學領域亟需解決的核心科學問題之一。根系在調控土壤碳動態(tài)中的重要作用已經(jīng)得到廣泛認可,并在很大程度上取決于根系功能屬性特征。具體而言,作為一個高度復雜且功能異質的分支系統(tǒng),根系生理代謝活性在吸收根和運輸根之間具有明顯差異,從而導致根際SOC固存和穩(wěn)定性在不同根系功能模塊間呈現(xiàn)出高度的異質性特征。但是,現(xiàn)有的根際模型和實驗研究大多將根際區(qū)簡單視為一個均一體,很少考慮根系生命活動誘導的根際土壤碳動態(tài)在根系功能屬性分化上的變異,極大地限制了在細微尺度上對森林生態(tài)系統(tǒng)土壤碳固存和穩(wěn)定性機制的全面認識與理...
作者: 植物所
發(fā)布時間: 2020 - 03 - 17
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高等植物的葉綠體是十億年前藍藻被真核生物吞噬后經(jīng)內(nèi)共生演化而來,共有3000個左右的蛋白,其中95%以上由核基因編碼。核基因編碼的葉綠體蛋白在細胞質中合成后,通過葉綠體內(nèi)、外被膜和類囊體膜轉運通道運輸?shù)饺~綠體內(nèi)的不同區(qū)域使葉綠體行使光合作用功能。因此,研究葉綠體蛋白跨膜運輸方式對于探討葉綠體的生物發(fā)生、光合器官的建成和功能以及真核生物的起源和進化等都具有重要意義。此前研究主要關注的是葉綠體被膜轉運通道以及類囊體膜轉運通道。然而,葉綠體蛋白在跨過葉綠體被膜之后,是如何穿過擁擠的基質空間,并精確地靶定到特異性的類囊體膜受體復合物的分子機制仍不清楚。中國科學院植物研究所張立新團隊以模式植物擬南芥為材料,發(fā)現(xiàn)了位于葉綠體基質的關鍵性蛋白轉運分選因子STT1與STT2,并揭示了其介導的分選、靶定機制。STT1與STT2形成寡聚體復合物特異d識別底物信號肽從而結合、分選底物,之后STT復合物與類囊體膜受體復合物Hcf106結合完成其靶定運輸過程。阻礙STT-Hcf106結合會阻斷Tat底物的運輸,影響植物光合作用從而導致植物致死的表型。相分離作為近年來細胞生物學的一個熱點受到了廣泛的關注,而相分離對植物生理活動的調控依然不清楚。該研究通過大量的體內(nèi)體外實驗進一步揭示了相分離參與調控底物的分選、靶定機制:底物結合激活STT復合物進一步的組裝相分離形成濃縮的液滴。STT-底物相分離液滴協(xié)助底物穿過葉綠體基質從而靶定到類囊體膜。而Hcf106能夠抑制STT的相分離從而釋放底物,完成底物的正確運輸與裝配。該研究首次發(fā)現(xiàn)了相分離(形成液滴)調控葉綠體蛋白的運輸,從而調控葉綠體的生物發(fā)生。同時該研究通過分析細菌、酵母、高等植物與動物的分選因子,發(fā)現(xiàn)相分離可能是驅動蛋白分選運輸?shù)钠毡闄C制。這是國際上首次提出相分離驅動葉綠體內(nèi)蛋白分選的新機制,強調了相分離調控蛋白運輸是在所有物種都存在的普遍機制,同時也開拓了相分離與蛋白運輸?shù)难芯款I域,為研究細胞是如何精確調控其各種生理活動拓展了思路。該研究成果于3月12日發(fā)表在國際學術期刊《細胞》(Cell)。
作者:
發(fā)布時間: 2020 - 01 - 13
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11月29日,PLoS Genetics 在線發(fā)表了中國科學院分子植物科學卓越創(chuàng)新中心/植物生理生態(tài)研究所薛紅衛(wèi)研究組題為SPOC domain-containing protein Leaf inclination3 interacts with LIP1 to regulate rice leaf inclination through auxin signaling 的研究論文。該研究發(fā)現(xiàn)水稻中的一個含有SPOC結構域的蛋白Leaf inclination3 (LC3)通過結合轉錄因子LIP1共同調控生長素信號,從而調控水稻葉傾角。水稻是重要的單子葉模式植物,也是我國乃至世界上最主要的糧食作物之一。株型對作物的生產(chǎn)和產(chǎn)量有著重要關系,而葉傾角又是水稻株型的關鍵組分之一。研究表明,適當?shù)娜~傾角有利于提高水稻光合效率,通過合理密植,能夠有效提高產(chǎn)量。盡管早已發(fā)現(xiàn)植物激素生長素影響葉傾角大小,且其代謝調控因子GH3和信號通路的關鍵組分IAA、ARF等被報道參與了葉傾角的調控,但對相關上游調控因子及機制仍了解較少,有待進一步闡明。研究組在前期工作中發(fā)現(xiàn)水稻缺失突變體LC3表現(xiàn)出葉傾角增大的表型。進一步的遺傳學、細胞生物學等分析表明LC3蛋白作為一個轉錄抑制子通過與LC3互作的轉錄因子LIP1協(xié)同抑制下游基因OsIAA12和OsGH3.2表達,通過抑制生長素信號,最終調控水稻葉傾角。此外,OsIAA2通過與OsARF17互作抑制生長素信號,揭示了OsIAA2-OsARF17在葉傾角發(fā)育調控中的特定功能。該研究有助于對生長素信號調控網(wǎng)絡的理解。也對研究植物中具有SPOC結構域的蛋白的功能提供了借鑒。值得一提的是,這是首次發(fā)現(xiàn)的僅含有SPOC結構域而不含RRM SPEN家族的成員。博士生陳素卉和周莉娟為論文第一作者。相關工作得到國家自然科學基金項目(91535201)以及“萬人計劃”的資助。(來源:中國科學院植物生理生態(tài)研究所) SPOC domain-containing protein Leaf inclination3 interacts with LIP1 to regulate rice leaf inclination through auxin signaling Abstract  Leaf angle is an important agronomic trait and influences crop architecture and yield. Studies have demonstr...
作者:
發(fā)布時間: 2018 - 11 - 22
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土壤有機碳時空變異模擬研究取得進展        受限于土壤樣點的時間維屬性,一般的土壤制圖只能獲得固定時間的“靜態(tài)”土壤圖,描述目前或過去狀態(tài)的格局。但是,土壤在不同土地利用條件下未來如何演變,在不同的氣候變化情景下呈現(xiàn)怎樣的時空變化特征?這是土壤時空變化預測的重要主題。中國科學院南京土壤研究所張甘霖課題組副研究員宋效東以土地利用變化頻繁的太湖周邊地區(qū)為例,深入研究了土壤有機碳含量空間變異的主導因素,提出了基于土壤發(fā)生理論的啟發(fā)式元胞自動機模型,模擬土壤有機碳含量在土地利用與氣候變化條件下未來60年內(nèi)的時空變異特征。有別于常規(guī)的元胞自動機模型,該方法不僅能夠有效集成影響土壤有機碳含量的靜態(tài)/動態(tài)環(huán)境變量,還能夠根據(jù)土地利用類型(旱地/水田)動態(tài)地度量有機碳富集對臨近區(qū)域有機碳水平遷移的影響范圍。鑒于土地利用類型的重要性,根據(jù)歷史土地利用圖層制作了研究區(qū)未來60年的土地利用變化圖。模擬結果表明:研究區(qū)土壤表層有機碳含量在未來60年內(nèi)隨著氣溫、降雨的升高與城鎮(zhèn)化進程的推進將呈現(xiàn)持續(xù)上升的趨勢。研究提出的預測模型為土壤屬性的時空變異模擬提供了新的解決方案與思路。該研究成果發(fā)表在Agriculture, Ecosystems and Environment上。研究得到國家重點研發(fā)計劃(2017YFA0603002)、科技基礎性工作專項(2008FY110600)、國家自然科學基金(41571130051和41771251)的資助。(來源:中國科學院南京土壤研究所) Heuristic cellular automaton model for simulating soil organic carbon under land use and climate change: A case study in eastern China Abstract  The concentration of soil organic carbon (SOC) is one of the most important soil properties, and its spatio-temporal variability greatly affects the global climate and agroecology. To investigate the effects of land use and climate change on SOC, a heuristic cellular automat...
作者:
發(fā)布時間: 2018 - 11 - 19
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研究發(fā)現(xiàn)植物草酸代謝途徑關鍵酶影響玉米營養(yǎng)品質            9月10日,The Plant Cell 在線發(fā)表了中國科學院分子植物科學卓越創(chuàng)新中心/植物生理生態(tài)研究所巫永睿研究組題為Maize Oxalyl-CoA Decarboxylase1 Degrades Oxalate and Affects the Seed Metabolome and Nutritional Quality 的研究論文。該研究克隆和功能解析了玉米草酸降解途徑中的關鍵酶——草酰輔酶A脫羧酶,揭示了草酸代謝參與籽粒儲藏物質積累和營養(yǎng)品質形成的分子機理。草酸是最簡單的二元酸,在植物體內(nèi)的含量非常高。草酸在調控金屬脅迫、離子平衡和昆蟲防御等方面起積極作用。然而,過量草酸不僅會影響植物自身發(fā)育,也會影響包括鈣元素在內(nèi)的多種礦物金屬礦物元素的利用;人體從食物中攝入草酸過多會和鈣形成草酸鈣,誘發(fā)形成腎結石。有報道顯示,植物體內(nèi)存在草酸合成和降解途徑,其中一條降解途徑由四種酶共同作用,分別為草酰輔酶A合成酶、草酰輔酶A脫羧酶、甲酰輔酶A水解酶和甲酸脫氫酶。草酰輔酶A合成酶可以催化草酸形成草酰輔酶A,接著草酰輔酶A在脫羧酶的作用下形成甲酰輔酶A。草酰輔酶A合成酶在多種植物中均被發(fā)現(xiàn),然而卻未有草酰輔酶A脫羧酶的報道,在農(nóng)作物玉米中,草酸的降解代謝途徑還未知,草酸與玉米籽粒發(fā)育、營養(yǎng)物質存儲和品質調控的關系也不清楚。在此項研究中,巫永睿研究組克隆了玉米草酰輔酶A脫羧酶(Oxalyl-CoA Decarboxylase1,OCD1)基因,該基因突變以后籽粒胚乳呈現(xiàn)出粉質的表型,同時籽粒的儲存物質合成和粒重也發(fā)生下降。由于沒有商業(yè)化的草酰輔酶A脫羧酶底物草酰輔酶A,研究人員嘗試了多種方法,合成了較高純度的草酰輔酶A。體外和體內(nèi)的酶活實驗證實草酰輔酶A脫羧酶可以降解草酰輔酶A產(chǎn)生甲酰輔酶A和二氧化碳。同時,研究人員還發(fā)現(xiàn)早先克隆的玉米經(jīng)典高賴氨酸突變體基因opaque7(o7)編碼草酰輔酶A合成酶,并證明O7可以催化草酸形成草酰輔酶A。另外,靶向和非靶向代謝組學分析發(fā)現(xiàn),玉米草酰輔酶A基因突變后籽粒胚乳的能量代謝、糖類、氨基酸以及激素含量均受到顯著影響。該項研究闡明了玉米草酸代謝的前兩步反應,并揭示了草酸降解途徑與籽粒胚乳發(fā)育、代謝和營養(yǎng)品質的關系,為將來遺傳改良草酸含量較高的蔬菜(如菠菜)等提供了候選基因和分子機制。該工作主要由巫永睿研究組副研究員楊俊和博士生付苗苗合作完成。博士生冀晨、...
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